辣椒疫霉根腐病、腐霉根腐病及茄子黄萎病、瓜类根结线虫等土传病虫害在有些地区逐年加重，常常带来严重的减产。另外，常年重茬引起土壤环境恶化，自毒作用明显，严重抑制了下茬蔬菜的生长。土壤消毒是防治这些土传病虫害为害作物的重要方法。
合理选择土壤消毒剂
随着菜农对土壤消毒重视程度的提高，市场上出现了各种形态的土壤消毒剂，如气体剂型的溴甲烷，颗粒剂型的棉隆、石灰氮，液体剂型的威百亩、氯化苦等。
1.拱棚与大棚选择消毒剂有区别。拱棚面积较大，且单位面积的蔬菜种植效益较大棚低，可选择相对便宜的土壤消毒剂。拱棚歇茬期相对较短，应考虑选择消毒时间短的消毒剂。而大棚歇茬期较长，要根据病虫害防治重点、土质等条件来选择。
2.根据病虫害防治重点选择土壤消毒剂。种植辣椒、茄子等的棚室及种植大姜的地块，土壤消毒的主要目的是杀灭土壤中引起辣椒根腐病、茄子黄萎病、姜瘟病等的土传病菌；种植丝瓜、苦瓜、黄瓜的棚室，土壤消毒的主要目的是杀灭土壤中的根结线虫。氯化苦虽然对病菌杀灭效果优异，但对根结线虫杀灭效果较差；而1，3二氯丙烯则对根结线虫有较好的杀灭效果，两者可配合施用。
科学使用土壤消毒剂
1.施用土壤消毒剂前精细整地。在施用土壤消毒剂前，先进行深翻，再用旋耕机旋地，使土壤颗粒细小而均匀。这样在一定程度上能充分发挥土壤消毒剂的效果。
2.保持适宜的土壤湿度。消毒时土壤湿度应保持在60%~70%。
3.正确覆盖塑料薄膜。施用土壤消毒剂后覆盖的塑料薄膜不能太薄，***好用无透膜（不透气）或厚度在0.04毫米以上的塑料薄膜。
4.保持一定的覆膜时间。施药后覆膜时间长短依温度而定，温度在30℃以上时，覆盖7~12天；温度在15℃~30℃时，覆盖12~15天。
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喷雾杀菌消毒方法：作为病菌铲除剂用于清园时，土壤温度须高于5℃，本品按1000倍稀释成药液，均匀喷雾至翻耕深处至土壤表层，即可杀菌消毒。
喷灌、滴灌杀菌消毒方法：本品使用足量清水稀释后，根据需要可一次加入肥料、微肥或其他农药，充分混合均匀后，可直接对栽种土壤和栽种靶标目标实施消毒杀菌，亩用量100-200g。